El máximo órgano de gobierno de la EPJ y del curso es la Comisión de Coordinación Académica, responsable del plan de formación y del sistema de garantía de calidad. Está integrada por:

• Los Decanos del Ilustre Colegio de la Abogacía de Salamanca y de la Facultad de Derecho -o personas en quienes éstos deleguen-,
• Los Codirectores,
• Dos profesores Doctores designados por la Facultad de Derecho
• Dos abogados en ejercicio designados por el I.C.A de Salamanca
• Y dos estudiantes del Curso.