El máximo órgano de gobierno de la EPJ y del curso es la Comisión de Coordinación Académica, responsable del plan de formación y del sistema de garantía de calidad. Está integrada por:

• los Decanos del Ilustre Colegio de Abogados de Salamanca y de la Facultad de Derecho -o personas en quienes éstos deleguen-,
• los Codirectores,
• dos profesores Doctores designados por la Facultad de Derecho
• dos abogados en ejercicio designados por el I.C.A de Salamanca
• y dos estudiantes del Curso.